提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
（新春走基层）重庆丰都：“九重天”民众吃上“旅游饭”******
中新网重庆1月31日电 (张旭)“我们这里以前是‘山穷水尽’，是‘九重天’让我们‘柳暗花明’。”重庆市丰都县双路镇莲花洞村6组村民廖长贵近日告诉记者，得益于家乡的九重天景区等项目，大家吃上了“旅游饭”，一切正变得越来越好。
丰都县双路镇位于三峡库区，于2015年通过招商引资，以“景区带村”模式建设研学康养项目，由丰都县双路九重天旅游开发有限公司投资11.9亿元，打造占地7000余亩的九重天研学康养基地和九重天景区。九重天景区于2018年被评为国家AAAA级景区。九重天研学康养基地于2022年评为“重庆市森林康养示范基地”。
1989年出生的莲花洞村村民田丰说，他此前在外打工，进厂生产汽车配件。听说家乡要开发旅游，他于2016年回到了家乡，最开始在景区做设备操作和维护。后来，他瞄准研学项目，通过培训和学习，成为一名研学教练，不仅实现了家门口就业，还拓展了技能。
“算起来，在家门口挣的钱，不比外出打工少。”田丰说，不仅他自己，家里所有人都在景区找到一份工作，这是在以前不敢想的事。此外，研学教练还有比较好的发展前景，这也是他比较看重的。
图为来“九重天”参加研学活动的民众。(资料图) 丰都县双路九重天旅游开发有限公司供图“我们与附近村民共享发展红利，除了提供就业外，村集体也有入股，村民有分红。”丰都县双路九重天旅游开发有限公司总经理赵胜建称，公司与当地结成“利益共同体”，用工以本地村民为主。村民吃“旅游饭”的方式不同，有就业、分红，还有从事农副产品售卖、农家乐经营等。
廖长贵此前在浙江一带打工，主要工作是拆房子。听说家乡的发展，他回乡，并于2018年开起了村里第一家农家乐，生意很好，“从五一开始，忙到年底，客源不断”，相比以前，收入自然也增加了。
赵胜建称，对于附近的莲花洞村、安宁场村，公司通过共建共享模式，统一规划开发、统一服务标准、统一管理模式，实行“公司＋农户＋市场”的运作，培育衍生多家农家乐。“甚至对于有想法而资金短缺的，我们也可以给予支持。”赵胜建说，下一步将不断拓宽就业、从业形式，增加村民经济收入，与当地共同发展。(完)
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